专项整治分为部署启动、自查自纠、检查督导和总结分析四个阶段。在10月至11月中旬的检查督导阶段，各地交通运输主管部门将对重点地区、重点项目进行抽查。发现存在突出问题和重大事故隐患的，责令停工整改并严肃处理，按规定上限处罚。对不符合安全生产条件的建设项目通报批评，对不具备安全生产条件的施工企业建议清退。交通运输部将适时组织对重点地区、重点项目进行专项督察。
　交通运输部要求，各地交通运输主管部门要紧紧抓住高速公路、大型水运工程等坍塌和高处坠落事故易发、多发的主要问题和薄弱环节，针对重点场所、要害部位、关键环节，重点突破，标本兼治。对前两年防坍塌事故专项整治进行认真梳理，查找顽症痼疾，集中解决。要抓好汛期、台风季节等重点时段的安全生产预控预警预案管理。
　据悉，“三违”行为是指在生产过程中违章指挥、违章操作、违反劳动纪律等行为。